番茄生理性病害在番茄栽培过程中发生较为普遍，并且往往能诱发侵染性病害的发生。及时识别和防治番茄生理性病害是促番茄产量及提高菜农收益的重要环节。

脐腐病

果实脐部先形成暗绿色水渍状斑, 后逐渐变成黑色。严重时病斑扩展至半个果面, 果肉组织干腐, 向内凹陷, 因腐生菌寄生而形成黑色霉状物。接近成熟期的青果易发生此现象, 幼果发病后, 果实增大而病斑不增大, 受害果实提早变色成熟。

畸形

果实表现为桃形、指形、歪扭、凹顶、尖顶、瘤状突起、大果脐、穿孔果、种子外露等畸形，失去商品价值。畸形果发生的原因除和品种的特性、播期过早有关系外, 低温、营养不良也是其发生的主要原因。

裂果

主要表现有3种:放射状裂果,从果蒂向果肩部延伸,呈放射状深裂,一般开始于果实绿熟期,转色前2-3天,裂痕明显;环状裂果,以果蒂为圆心，呈同心圆状浅裂，多在果实成熟前出现；混合型裂果，既有放射状裂果，也有环状裂果。

日灼病

果实初呈透明革质状,后变白色或有黄褐色斑,有的出现皱纹,干缩变硬后凹陷,果肉褐色;叶片发生日灼,表现为褪色,呈漂白状,后叶缘枯焦或黄化枯死。果实膨大期天气干旱!土壤缺水，果实及叶片在烈日照射下水分蒸发快，部分组织温度骤升而烫坏，一般向阳面的果实及叶片发生较重。

浮肿

水果显得有些臃肿、扁平或有棱角。当水果被切开时，可能会出现缺乏正常种子凝胶的空洞。水果密度较低。浮肿是由授粉和种子发育不完全以及施肥不足引起的。授粉不良可能发生在坐果期间温度过低或过高的情况下。其他因素，如弱光或多雨条件也可能导致种子结实问题。

筋腐病

多发生在果实膨大期， 果面出现黄绿色或灰色斑,果实横剖面可见维管束呈茶褐色坏死,果心出现白色或褐色坚硬的木质化组织,果肉呈糠心状,品质变劣,无商品价值。

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